RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CELA1Q9UNI1 258 aa6.78□□□□□ -1.32
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.78□□□□□ -1.32
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.77□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRPXP78539 464 aa6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.77□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 MCUBQ9NWR8 336 aa6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.77□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PITX3O75364 302 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 AKR1C4P17516 323 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 GAMTQ14353 236 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.76□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.76□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM63Q969Q1 353 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.76□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.75□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZFP92A6NM28 416 aa6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BMQ9 156 aa6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SCGB1D2O95969 90 aa6.75□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMB3P49720 205 aa6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFB1P60022 68 aa6.75□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF709Q8N972 641 aa6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.75□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC35E1Q96K37 410 aa6.75□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 NEU1Q99519 415 aa6.75□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.74□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR1S1Q8NH92 325 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MCFD2Q8NI22 146 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C20orf173Q96LM9 149 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRGV9Q99603 122 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 V9GYH0 126 aa6.74□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM189A5PLL7 270 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS46E5RG02 174 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ISLRO14498 428 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IAPPP10997 89 aa6.73□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ID1P41134 155 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PAX9P55771 341 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AP3S2P59780 193 aa6.73□□□□□ -1.33
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00052Q96N35 136 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RYR1P21817 5038 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A8MTW9 85 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV3-20P01619 116 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2F1Q13607 317 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COQ8AQ8NI60 647 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C17orf77Q96MU5 243 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.72□□□□□ -1.33
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