RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	ID3	Q02535	119 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2F1	Q13607	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAP1	O75689	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	BTC	P35070	178 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMB3	P49720	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIQK	Q629K1	86 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BP45	60 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4E1	P0C645	316 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ID1	P41134	155 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	INPP1	P49441	399 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB1	P60022	68 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC4	Q99102	2169 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ISLR	O14498	428 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZTC4	211 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	NEU1	Q99519	415 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF98	A6NK75	572 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX9	P55771	341 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAH2	Q9P225	4427 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	IL7	P13232	177 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	MEOX2	P50222	304 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR1C1	Q04828	323 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM8	Q96KF7	97 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PKHD1	P08F94	4074 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0J9YX75	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPX	A8MT69	81 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLL5	B9A064	214 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA21	P01568	189 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	GALR1	P47211	349 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf173	Q96LM9	149 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MTW9	85 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SSSCA1	O60232	199 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	ORM2	P19652	201 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PLP1	P60201	277 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR82	Q96P67	336 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A22	Q9H936	323 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC10	F2Z333	226 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		F6UB75	175 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BRN7	92 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G10	O15496	165 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNK	O75909	580 aa		12.71	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms