RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEDDO75618 318 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCAP31P51572 246 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAV2P51636 162 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GGACTQ9BVM4 153 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRN1Q9NPD7 142 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFDN2Q9UHV9 154 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ORM2P19652 201 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf194Q5T5A4 169 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CST7O76096 145 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZWC4 215 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC45A2Q9UMX9 530 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2CO00762 179 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB135Q30KP9 77 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEPPQ6URK8 271 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR1B1Q8NGR6 318 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC7Q8TAX7 377 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGSF23A1L1A6 192 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H2BFSP57053 126 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NMES1Q9C002 83 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSTL1Q9H114 145 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DOK5Q9P104 306 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF98A6NK75 572 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KNCNA6PVL3 124 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00869P0C866 280 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLP1P60201 277 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMG4Q5JS54 123 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR8I2Q8N0Y5 310 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C17orf77Q96MU5 243 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A32Q9H2D1 315 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXL17Q9UF56 701 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSMD3Q7Z407 3707 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRY2O43597 315 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SULT1A1P50225 295 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SELENOTP62341 195 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF183Q96D59 192 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MGST2Q99735 147 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STARD9Q9P2P6 4700 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0YIZ8 118 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C3orf84H3BNL1 204 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOCS3O14543 225 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGPAT2O15120 278 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCRT1Q9BWW7 348 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A22Q9H936 323 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BRN7 92 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSNA1O43805 119 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HYPMO75409 117 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VWC2Q2TAL6 325 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PATE2Q6UY27 113 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STHQ8IWL8 128 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5AC2Q9NZP5 309 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTTG1O95997 202 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTL10Q5JWF8 245 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 S100A11P31949 105 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYCSP99999 105 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF546Q86UE3 836 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UHRF2Q96PU4 802 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARL6Q9H0F7 186 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR83OSQ9Y284 106 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5G3P0C626 314 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASC10Q5T4H9 136 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STX12Q86Y82 276 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSG1Q9BU20 258 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALG5Q9Y673 324 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGRNO00468 2067 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CA1P00915 261 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LYL1P12980 280 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GALR1P47211 349 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB1P60022 68 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAP2BP61225 183 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E5RGE8 158 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RLN2P04090 185 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMLGP49069 296 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMB3P49720 205 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHLH2Q02577 135 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00052Q96N35 136 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF126Q9BV68 326 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARV1Q9H2C2 271 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms