RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 COLCA2A8K830 154 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CD28P10747 220 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXL1Q12952 345 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ACACBO00763 2458 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01559Q495D7 138 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 GAGE13Q4V321 117 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 SMPXQ9UHP9 88 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LHX2P50458 406 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 WFDC1Q9HC57 220 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ERG28Q9UKR5 140 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TREML4Q6UXN2 200 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LYZL4Q96KX0 146 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 EVI2AP22794 236 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 GAGE2BQ13066 116 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 GAGE2EQ4V326 116 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 STHQ8IWL8 128 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCL1P09341 107 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK11-1P61568 191 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN8Q156A1 80 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CSRP2Q16527 193 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFS8O00217 210 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM23O14925 209 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 VSIRQ9H7M9 311 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 COL4A2P08572 1712 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV3-19P01714 112 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKN1AP38936 164 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXF2Q12947 444 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01551Q86U37 167 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1D-12P01611 117 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM166AQ6J272 317 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF14Q92956 283 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-202ENST00000426333 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0A6YYD4 124 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PRX2 142 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 OVOL1O14753 267 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CD33P20138 364 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPPLY3P57055 190 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 AGMATQ9BSE5 352 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM238C9JI98 176 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 J3QRE1 110 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R2P5 195 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LYPD3O95274 346 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRM5B3KS81 715 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TFF1P04155 84 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX8Q06710 450 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYGSP22914 178 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GFI1Q99684 422 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 JPT2Q9H910 190 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LYNX1P0DP58 116 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00158P58513 81 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TNCP24821 2201 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PLXNA2O75051 1894 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WX48 190 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 DLEU1O43261 78 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms