RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 S100PP25815 95 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 MFAP4P55083 255 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ECSCRQ19T08 205 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf52Q96A22 123 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DRB1P01911 266 aa3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 FXYD5Q96DB9 178 aa3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 THYN1Q9P016 225 aa3.13□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 LY6EQ16553 131 aa3.12□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.12□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.12□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf52A6NGY3 159 aa3.11□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX7O00628 323 aa3.11□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 PAX4O43316 350 aa3.11□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM40O96008 361 aa3.11□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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