RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA0556O60303 1618 aa-4.32□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMIM30A4D0T7 59 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VAPBO95292 243 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANXA5P08758 320 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SDC4P31431 198 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARPINQ7Z6K5 226 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR7G1Q8NGA0 311 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR4K17Q8NGC6 315 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR52E4Q8NGH9 312 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DOK4Q8TEW6 326 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB37Q96AX2 223 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRC45Q96CN5 670 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USMG5Q96IX5 58 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR52A5Q9H2C5 316 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BCL2L10Q9HD36 194 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIF3AQ9Y496 699 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRC1P22897 1456 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NCAPD2Q15021 1401 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C17orf112F2Z3M2 114 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H0Y980 276 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H0YJX3 145 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 I3L521 148 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 E2F6O75461 281 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM33P57088 247 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPC2P61916 151 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HBA1P69905 142 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CENPWQ5EE01 88 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UQCC3Q6UW78 93 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD302Q8IX05 232 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NATD1Q8N6N6 113 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB18Q9NP72 206 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL19Q9UHD0 177 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DEGS1O15121 323 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SULT1A1P50225 295 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFITM2Q01629 132 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q5VV11 94 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HACD4Q5VWC8 232 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C3orf18Q9UK00 162 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ECM29Q5VYK3 1845 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNTNA6NMZ2 147 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 J3KRW8 73 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 hCG_2039718K7EN88 272 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR2F1Q13607 317 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTC23Q5W5X9 447 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LYPD5Q6UWN5 251 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SCD5Q86SK9 330 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CPXCR1Q8N123 301 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00269Q8N2A0 174 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WFDC9Q8NEX5 89 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLK6Q92876 244 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DMAC1Q96GE9 116 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO44Q9H4M3 255 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMCO2A6NFE2 343 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR2AG2A6NM03 316 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H7BZZ5 65 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 M0R1B8 84 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 M0R381 172 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRASO14807 208 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARPC3O15145 178 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSPAN12O95859 305 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCGP01275 180 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GABRR2P28476 465 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RRM2P31350 389 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLDN12P56749 244 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C9orf72Q96LT7 481 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANP32EQ9BTT0 268 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB1BQ9H0U4 201 aa-4.37□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADCY9O60503 1353 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BICDL2A1A5D9 508 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H3BN98 237 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 M0QYV0 167 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNAP29O95721 258 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPOPLQ6IQ16 392 aa-4.38□□□□□ -3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms