RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 HCFC1P51610 2035 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf71A4D174 169 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM238C9JI98 176 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CHEK1O14757 476 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 P01737 135 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GATA3P23771 443 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PRDX2P32119 198 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CFHR2P36980 270 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MPV17P39210 176 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PSG9Q00887 426 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GUSBP1Q15486 140 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01545Q5VT33 79 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 Q6AWC8 147 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PDPNQ86YL7 162 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PRORYQ9H606 182 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MED12LQ86YW9 2145 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T8A6NH00 312 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 HTR1DP28221 377 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CAMPP49913 170 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PAX2Q02962 417 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MUC21Q5SSG8 566 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GFRALQ6UXV0 394 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZT83 130 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SSX8Q7RTT4 187 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF329Q86UD4 541 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR4A5Q8NH83 315 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF503Q96F45 646 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PROCRQ9UNN8 238 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK7Q96N67 2140 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf118A6NHY6 69 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 J3QR89 54 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 M0QZ24 198 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 UPK2O00526 184 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 Q8TCH9 128 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 EPDR1Q9UM22 224 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MAST4O15021 2626 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SRRM5B3KS81 715 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 G3V4G9 280 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PROP1O75360 226 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 APOA2P02652 100 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TIRAPP58753 221 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 HSD52Q0P140 79 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RIGQ13278 110 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 EDDM3AQ14507 147 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RFESDQ8TAC1 157 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 HINT2Q9BX68 163 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CALYQ9NYX4 217 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RNF24Q9Y225 148 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB11A5LHX3 300 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 K7EP34 96 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 WNT9BO14905 357 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGF2RP11717 2491 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FRYQ5TBA9 3013 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms