RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 STARD9Q9P2P6 4700 aa10.99□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 KNCNA6PVL3 124 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 FNDC10F2Z333 226 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 CST7O76096 145 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 ORM2P19652 201 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DL5AQ8N109 375 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 OR1B1Q8NGR6 318 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 NPVFQ9HCQ7 196 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 DOK5Q9P104 306 aa10.98□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 IGSF23A1L1A6 192 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 CFDP00746 253 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00869P0C866 280 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 PSMG4Q5JS54 123 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A32Q9H2D1 315 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.97□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 AGRNO00468 2067 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF98A6NK75 572 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 C3orf84H3BNL1 204 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 H3BRN7 92 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2CO00762 179 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 DEDDO75618 318 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 TEPPQ6URK8 271 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZWC4 215 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf77Q96MU5 243 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 MGST2Q99735 147 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM147Q9BVK8 224 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 GGACTQ9BVM4 153 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 CSTL1Q9H114 145 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A22Q9H936 323 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG1-201ENST00000361211 H0YIZ8 118 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SOCS3O14543 225 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SPRY2O43597 315 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 H2BFSP57053 126 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 STHQ8IWL8 128 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 RNF183Q96D59 192 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 NMES1Q9C002 83 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL17Q9UF56 701 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 AGPAT2O15120 278 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1A1P50225 295 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB1P60022 68 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 PLP1P60201 277 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SELENOTP62341 195 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 CASC10Q5T4H9 136 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 PATE2Q6UY27 113 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 UHRF2Q96PU4 802 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SSNA1O43805 119 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 HYPMO75409 117 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 OR5G3P0C626 314 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 LYL1P12980 280 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 C4BPBP20851 252 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 RAP2BP61225 183 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ARL6Q9H0F7 186 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0J9YWU9 116 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 GALR1P47211 349 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 VWC2Q2TAL6 325 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF546Q86UE3 836 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 STX12Q86Y82 276 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ARV1Q9H2C2 271 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 ALG5Q9Y673 324 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 PTTG1O95997 202 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 S100A11P31949 105 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 CAMLGP49069 296 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 PSMB3P49720 205 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 MIC13Q5XKP0 118 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms