RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 OBSL1O75147 1896 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 OOSP1A8MZH6 123 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LEPROTO15243 131 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LHX2P50458 406 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 FOXL2P58012 376 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1W2PR77 199 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CDK2AP2O75956 126 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 UMODP07911 640 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ID3Q02535 119 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GFRA3O60609 400 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 HAX1O00165 279 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 S4R3C0 116 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SHISA3A0PJX4 238 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 AMBPP02760 352 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV1-2P23083 117 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PSG7Q13046 419 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 WFDC1Q9HC57 220 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 RASL10AQ92737 203 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LINC01560Q8TB33 94 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 A0A0U1RRA0 63 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 FNDC10F2Z333 226 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TOMM40O96008 361 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 NAPSAO96009 420 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 WBP1Q96G27 269 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GZMBP10144 247 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 F8WEM9 126 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PTPN13Q12923 2485 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 THBDP07204 575 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CELA3BP08861 270 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 A0A0G2JMM0 328 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 A0A1W2PPB8 328 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 HTN3P15516 51 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 OCC1Q8TAD7 63 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CFHR1Q03591 330 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PAX8Q06710 450 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 VGLL1Q99990 258 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 COL4A5P29400 1685 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MESP2Q0VG99 397 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 DSCAMO60469 2012 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 OR9G9P0C7N8 305 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF124Q15973 351 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CST9LQ9H4G1 147 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 COLCA2A8K830 154 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 WNT2P09544 360 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CSRP2Q16527 193 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 JPT2Q9H910 190 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TIAF1O95411 115 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 PRTN3P24158 256 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LYZL4Q96KX0 146 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CTSBP07858 339 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 EVI2AP22794 236 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 VCYO14598 125 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 CELA3AP09093 270 aa6.6□□□□□ -1.35
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