RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 GPX1P07203 203 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 DLX6P56179 175 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 MMDQ15546 238 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PDPNQ86YL7 162 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C3orf79P0CE67 100 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 UBE2G1P62253 170 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 MUC15Q8N387 334 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TSKUQ8WUA8 353 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R60P59551 318 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 RPEQ96AT9 228 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 VAMP8Q9BV40 100 aa6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PAX1P15863 534 aa6.9□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 Q8N976 141 aa6.9□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 GTSF1Q8WW33 167 aa6.9□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.9□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 NIT1Q86X76 327 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 Q9H3A6 140 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 RAXQ9Y2V3 346 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PRE2 83 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ITGB1BP1O14713 200 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 AMY1AP04745 511 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SELENOTP62341 195 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 TMEM186Q96B77 213 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 EPDR1Q9UM22 224 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SORL1Q92673 2214 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SNAI2O43623 268 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 CD3EP07766 207 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 BRS3P32247 399 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SPATA45Q537H7 98 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 MBD6Q96DN6 1003 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 TEX22C9J3V5 150 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 NPSP0C0P6 89 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DMBP28068 263 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 RAB9BQ9NP90 201 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 OSTCQ9NRP0 149 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 HYPMO75409 117 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 BPIFB3P59826 476 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 ACACBO00763 2458 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PPR1 153 aa6.87□□□□□ -1.31
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GINS1-201ENST00000262460 M0R143 59 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 M0R2Z0 102 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 HSBP1O75506 76 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 IL4P05112 153 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 TMEM11P17152 192 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 FOXE3Q13461 319 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 KCNS1Q96KK3 526 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 C8orf49Q96NF6 230 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 OR8B2Q96RD0 313 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS1-201ENST00000262460 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.87□□□□□ -1.31
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