RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 M0QZK8 103 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 PRRX1P54821 245 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 ARF6P62330 175 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 PERPQ96FX8 193 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 LOXL4Q96JB6 756 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 Q9H3A6 140 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 C22orf46C9J442 243 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 CTSZQ9UBR2 303 aa10.78□□□□□ -0.68
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 M0R3E3 92 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CFHR2P36980 270 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 MUC15Q8N387 334 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.77□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 VWC2LB2RUY7 222 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CA7P43166 264 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGLC2P0DOY2 106 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGLC3P0DOY3 106 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PSG1P11464 419 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PNKDQ8N490 385 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FXYD5Q96DB9 178 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR4C46A6NHA9 309 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PRSS33Q8NF86 280 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.76□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM178BH3BS89 294 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TM4SF5O14894 197 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 LEPROTL1O95214 131 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CRYABP02511 175 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGLL1P15814 213 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 GPR82Q96P67 336 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FCN3O75636 299 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.75□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CGB1A6NKQ9 187 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 A8MWL6 223 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 AARDQ4LEZ3 155 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PAX1P15863 534 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 UQCRFS1P47985 274 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 HBBP68871 147 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 NUDT3O95989 172 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CR1LQ2VPA4 569 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM186Q96B77 213 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PTPRBP23467 1997 aa10.74□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TSPOP30536 169 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IL4P05112 153 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 MPV17L2Q567V2 206 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CENPEQ02224 2701 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.73□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 GATA4P43694 442 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 KLRD1Q13241 179 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 GTSF1Q8WW33 167 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 FOXC1Q12948 553 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N976 141 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF596Q8TC21 504 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms