RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 RRN3P1Q2M238 152 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 PRR31Q5SQ13 230 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 C15orf61A6NNL5 157 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 LIME1Q9H400 295 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 IGKV3-15P01624 115 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 ECSCRQ19T08 205 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 SIP14410 1827 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 CCL1P22362 96 aa9.41□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 GFRA3O60609 400 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 C12orf77C9JDV5 145 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 LINC00271P0C7V0 271 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 FAM166AQ6J272 317 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 CT55Q8WUE5 264 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 NOTCH4Q99466 2003 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 SDK2Q58EX2 2172 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 PATJQ8NI35 1801 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 ATOX1O00244 68 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.4□□□□□ -0.9
ZBED4-201ENST00000216268 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 SOCS3O14543 225 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PAX1P15863 534 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FOXI1Q12951 378 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CRPP02741 224 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 HLA-DMBP28068 263 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 RCHY1Q96PM5 261 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.4□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 NPYP01303 97 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 NPC2P61916 151 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 VOPP1Q96AW1 172 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 APC2O95996 2303 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FGF6P10767 208 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 SHISA5Q8N114 240 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 V9GYV3 84 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CEACAM4O75871 244 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGLL5B9A064 214 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGKV3-11P04433 115 aa9.39□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 C4orf51C9J302 202 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 TDRG1Q3Y452 100 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 GATD1Q8NB37 220 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CACNA1HO95180 2353 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 A0A0C4DFX4 3053 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 KNCNA6PVL3 124 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CTSBP07858 339 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 ZNHIT1O43257 154 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CD28P10747 220 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 TMEM243Q9BU79 118 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 LMO7DNF2Z398 122 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 WNT2P09544 360 aa9.38□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FOXS1O43638 330 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 LYPD3O95274 346 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FAM106CPP0CH98 169 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 LEAP2Q969E1 77 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PRR33A8MZF0 331 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 A0A1W2PPI3 338 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PRRG2O14669 202 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 AGFG2O95081 481 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CFPP27918 469 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CARD19Q96LW7 228 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CCL13Q99616 98 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 TEN1Q86WV5 123 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 CD69Q07108 199 aa9.37□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 UPK2O00526 184 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 TCRAP04437 139 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 FOXC1Q12948 553 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 WFDC2Q14508 124 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 HES7Q9BYE0 225 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF492Q9P255 531 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.36□□□□□ -0.91
ZBED4-201ENST00000216268 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.9 ms