RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MC5R	P33032	325 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TPPP2	P59282	170 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1B0GUS0	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		K7EN84	100 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		M0QZK8	103 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MYOD1	P15172	320 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A16	P16260	332 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A096LNT2	108 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00869	P0C866	280 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CRISP2	P16562	243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS4	P56470	323 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00310	P59036	64 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	UPK2	O00526	184 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TIMM23	O14925	209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CBLN1	P23435	193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CEACAM3	P40198	252 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PAX8	Q06710	450 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC17A3	O00476	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10J4	P0C629	311 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	GNG4	P50150	75 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TAS2R45	P59539	299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PSG5	Q15238	335 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ITPR3	Q14573	2671 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PDZD2	O15018	2839 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ABCA1	O95477	2261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	HELT	A6NFD8	242 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A17	O43808	307 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CNTFR	P26992	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2E1	P51965	193 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	COX19	Q49B96	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		Q6ZWC4	215 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CFHR4	Q92496	578 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		V9GYV3	84 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	FCN1	O00602	326 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ACTL6B	O94805	426 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MSMB	P08118	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MT-ND6	P03923	174 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS7	P47929	136 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		Q0VG73	95 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481		Q5PR19	223 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5G3	P0C626	314 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	CD24	P25063	80 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	IER3	P46695	156 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-208	ENST00000638481	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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