RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 GNLYP22749 145 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 UBE2G1P62253 170 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 RANP62826 216 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 EBI3Q14213 229 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.69□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PRF3 423 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PRM7 423 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 PGPA6NDG6 321 aa14.68□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 CX3CL1P78423 397 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 Q8N6K4 173 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TMEM68Q96MH6 324 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.67□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.67□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 SCGB2A1O75556 95 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 TOX4O94842 621 aa14.66□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 UQCRFS1P47985 274 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 UBE2E1P51965 193 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLN8-211ENST00000636934 OTORQ9NRC9 128 aa14.66□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 THYN1Q9P016 225 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 LINC00479Q96M42 142 aa14.65□□□□□ -0.06
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CLN8-211ENST00000636934 BRS3P32247 399 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-211ENST00000636934 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-211ENST00000636934 Q9H3A6 140 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-211ENST00000636934 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 GNG7O60262 68 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-211ENST00000636934 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 C19orf84I3L1E1 186 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 OVOL3O00110 214 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 TCRAP04437 139 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 CRISP2P16562 243 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 LMO4P61968 165 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 LEMD1Q68G75 181 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-211ENST00000636934 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.62□□□□□ -0.07
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