RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	OSTC	Q9NRP0	149 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	ISLR	O14498	428 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOT	P62341	195 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF329	Q86UD4	541 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00310	P59036	64 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	CX3CL1	P78423	397 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		10.48	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	PEX7	O00628	323 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	CD24	P25063	80 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	FSTL3	O95633	263 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	NPS	P0C0P6	89 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRD5	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRF3	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRM7	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	ARF6	P62330	175 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.46	□□□□□ -0.73
BRF1-222	ENST00000635152	PGP	A6NDG6	321 aa		10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.46	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152		A6NNC1	897 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PERP	Q96FX8	193 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TOX4	O94842	621 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CRYGC	P07315	174 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CRYGB	P07316	175 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RAB4A	P20338	218 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CA7	P43166	264 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZWC4	215 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.45	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CNIH1	O95406	144 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	LYZ	P61626	148 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2G1	P62253	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM23	O14925	209 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HYPM	O75409	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TPPP2	P59282	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	MMD	Q15546	238 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CORT	O00230	105 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RBP4	P02753	201 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT11	Q96G61	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PSG1	P11464	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SRI	P30626	198 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	KLRD1	Q13241	179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TRGV9	Q99603	122 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152		S4R3C0	116 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CDKN1A	P38936	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	WDR73	Q6P4I2	378 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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