RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF114Q9Y508 228 aa11.28□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.28□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.28□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNFSF13O75888 250 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 MGST2Q99735 147 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 B4DSR2 109 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 F8VVB4 439 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 F8VWA3 439 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 UBE2CO00762 179 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF876PQ49A33 203 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.27□□□□□ -0.6
SLC35E2B-205ENST00000617444 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 CGB7P0DN87 165 aa11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 H3BUX3 64 aa11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 H0YIZ8 118 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 EREGO14944 169 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TIMP3P35625 211 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 GATA4P43694 442 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 POLEQ07864 2286 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 VWC2LB2RUY7 222 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 C2orf82Q6UX34 121 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RASL10AQ92737 203 aa11.26□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 FGF16O43320 207 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNFRSF6BO95407 300 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 NCR2O95944 276 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 LHBP01229 141 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNFRSF14Q92956 283 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF124Q15973 351 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DTX1Q86Y01 620 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 A6NNC1 897 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 D6R8Y8 96 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEFB130BP0DP73 79 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEFB130AP0DP74 79 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPTBN2O15020 2390 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV1-46P01743 117 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 AMBPP02760 352 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITGB1BP1O14713 200 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 BTCP35070 178 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXF2Q12947 444 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 TREML4Q6UXN2 200 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF329Q86UD4 541 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.24□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF223E7ERA6 249 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 MLNRO43193 412 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 NDPQ00604 133 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 GUSBP1Q15486 140 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 VSIRQ9H7M9 311 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 WFDC1Q9HC57 220 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 C15orf32Q32M92 178 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.23□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.22□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SLC35E2B-205ENST00000617444 PINLYPA6NC86 204 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms