RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SIX6O95475 246 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35E1Q96K37 410 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 GINS3Q9BRX5 216 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM229AH3BQW9 127 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CHEK1O14757 476 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM40O96008 361 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB32Q13637 225 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8WTZ3 238 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF2Q99496 336 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP92A6NM28 416 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CD7P09564 240 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 PSG1P11464 419 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 H2BFSP57053 126 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A10P60903 97 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF90Q03938 601 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 GUCA2BQ16661 112 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 THAP8Q8NA92 274 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 VSIRQ9H7M9 311 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SMLR1H3BR10 107 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 L7N2F9 121 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPAN4O14817 238 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IL4P05112 153 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RD3LP0DJH9 198 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 NPPCP23582 126 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYBB3P26998 211 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 VAMP2P63027 116 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL16Q0P5N6 197 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 LILRB2Q8N423 598 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ST8SIA2Q92186 375 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL26Q96S19 204 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 NMES1Q9C002 83 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 G3V3Q6 166 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 C1QBP02746 253 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CD81P60033 236 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP69Q49AA0 526 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TRGV9Q99603 122 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 B9D2Q9BPU9 175 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 U3KQE9 123 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 DEDDO75618 318 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CAV2P51636 162 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 DLK1P80370 383 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 AKR1C1Q04828 323 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF125Q96EQ8 232 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PS18 150 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SMCO3A2RU48 225 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 A8MZ25 164 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FNDC10F2Z333 226 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 H0YIZ8 118 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 DFFBO76075 338 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CST7O76096 145 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 BMI1P35226 326 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2F1Q13607 317 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 Q5BKY6 102 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TCF24Q7RTU0 167 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL3L3-201ENST00000612839 IGSF23A1L1A6 192 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL3L3-201ENST00000612839 FABP1P07148 127 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL3L3-201ENST00000612839 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL3L3-201ENST00000612839 P2RY1P47900 373 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms