RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602710.5

UBE2E3-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-209ENST00000602710 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3-209ENST00000602710 TOMM40O96008 361 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3-209ENST00000602710 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3-209ENST00000602710 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3-209ENST00000602710 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SCGB2A1O75556 95 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 B2MP61769 119 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SELENOTP62341 195 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM209BQ5JX69 171 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 YIF1AO95070 293 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 FABP1P07148 127 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 OR11H1Q8NG94 326 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 Q8WTZ3 238 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 TSPAN15O95858 294 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SEC11BP0C7V7 166 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RAX2Q96IS3 184 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 CITED1Q99966 193 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 VSIRQ9H7M9 311 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 DOK5Q9P104 306 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 LYZP61626 148 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 IL4P05112 153 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ORM2P19652 201 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RIPPLY3P57055 190 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SERF2P84101 59 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RPEL1Q2QD12 228 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 TEX261Q6UWH6 196 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 DPF1Q92782 380 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 LINC01619G3V211 115 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 SLURP1P55000 103 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RAB2AP61019 212 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 IFITM2Q01629 132 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PATE2Q6UY27 113 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 Q6ZRG5 221 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RNF125Q96EQ8 232 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 CCL24O00175 119 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 NDUFA4O00483 81 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 GPHB5Q86YW7 130 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF320A2RRD8 509 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 OR5G3P0C626 314 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 PLP1P60201 277 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 RPRMQ9NS64 109 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3-209ENST00000602710 HYPMO75409 117 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 M6PRP20645 277 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 ZP3P21754 424 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 SYNJ2BPP57105 145 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 UHRF2Q96PU4 802 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF747Q9BV97 191 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 COX7A2P2O60397 106 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 FHITP49789 147 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 FHL3Q13643 280 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 C3orf56Q8N813 242 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2E3-209ENST00000602710 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms