RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 C11orf94C9JXX5 98 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 BUB3O43684 328 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 AP3S2P59780 193 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 PSMG4Q5JS54 123 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 RBKSQ9H477 322 aa15.02■□□□□ -0
NFIC-209ENST00000589969 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 PSG1P11464 419 aa15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 OR1S1Q8NH92 325 aa15.01□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 FAM90A26D6RGX4 464 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 FABP1P07148 127 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 C4BPBP20851 252 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 TMEM128Q5BJH2 165 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 OR8G2PQ6IF36 304 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RNF125Q96EQ8 232 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.99□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 SLC35E1Q96K37 410 aa14.99□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 KMT2AQ03164 3969 aa14.99□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 ZFP92A6NM28 416 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 GAMTQ14353 236 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 X6R8D5 127 aa14.98□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 SLC25A6P12236 298 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 RAB11AP62491 216 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 PYDC2Q56P42 97 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 LRTM2Q8N967 370 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 AGRNO00468 2067 aa14.97□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 H3BMM0 161 aa14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 PITX3O75364 302 aa14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 TRIM63Q969Q1 353 aa14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.96□□□□□ -0.01
NFIC-209ENST00000589969 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 IGLL5B9A064 214 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 MED6O75586 246 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 DEDDO75618 318 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 HLA-DMBP28068 263 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 S100A5P33763 92 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.95□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 HLA-DRB4P13762 266 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 VAMP1P23763 118 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 ID1P41134 155 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 ZNF90Q03938 601 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.94□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.93□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 TRGV9Q99603 122 aa14.93□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 APLNQ9ULZ1 77 aa14.93□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 V9GYH0 126 aa14.93□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 PSMB3P49720 205 aa14.92□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 LYZP61626 148 aa14.92□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 XCL2Q9UBD3 114 aa14.92□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.92□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 SFT2D2O95562 160 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 IAPPP10997 89 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 Q6ZTC4 211 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 THAP8Q8NA92 274 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 SYNGR2O43760 224 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 ZNF79Q15937 498 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 COQ8AQ8NI60 647 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 LINC00052Q96N35 136 aa14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NFIC-209ENST00000589969 CCDC160A6NGH7 325 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 S100A7P31151 101 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 PPP1R1AQ13522 171 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 OR2F1Q13607 317 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 NEU1Q99519 415 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 RNF126Q9BV68 326 aa14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NFIC-209ENST00000589969 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms