RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 BAP18Q8IXM2 172 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB125Q8N687 156 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 NMES1Q9C002 83 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR51M1Q9H341 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 NAA60Q9H7X0 242 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf170A2RU37 121 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 A8MWP6 167 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 A8MZ25 164 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA4O00483 81 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR5O14804 337 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GNG7O60262 68 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 MT-CO2P00403 227 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CD5P06127 495 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 S100A6P06703 90 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 AKR1C4P17516 323 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 S100PP25815 95 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 UCP1P25874 307 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CAV2P51636 162 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RAB5BP61020 215 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PEA15Q15121 130 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM8Q96KF7 97 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TXN2Q99757 166 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RNF126Q9BV68 326 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GPR132Q9UNW8 380 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0G2JRQ6 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 I3L2K1 104 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CDS2O95674 445 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 FABP1P07148 127 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CTSGP08311 255 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SPP1P10451 314 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 NPBWR1P48145 328 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 HAGHQ16775 308 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 FAM219AQ8IW50 185 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF114Q8NC26 417 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GPR146Q96CH1 333 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V0BQ99437 205 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA25Q9BR10 227 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RYR3Q15413 4870 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf62A8K5M9 175 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00587B1AMM8 73 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 F8W735 103 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 K7EMT4 169 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CORTO00230 105 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 NXPH3O95157 252 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND4LP03901 98 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf88P0DMB2 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ADMP35318 185 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 OPRK1P41145 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SPCS3P61009 180 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 XP32Q5T750 250 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZRM9 215 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 AQP10Q96PS8 301 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PRR13Q9NZ81 148 aa6.25□□□□□ -1.41
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