RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV5A0A0B4J249 113 aa19.27■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WT1-ASQ06250 92 aa19.27■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2T6Q8NHC8 308 aa19.27■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNG8Q8WXS5 425 aa19.27■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD10Q9BYL1 202 aa19.27■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PN81 502 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A6NNC1 897 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPX1P07203 203 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCL1AP56279 114 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC35B1P78383 322 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXL7Q9UJT9 491 aa19.26■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLXNB1O43157 2135 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLRD1Q13241 179 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP6Q13023 2319 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INS-IGF2F8WCM5 200 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA1644Q3SXP7 199 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COX19Q49B96 90 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR10J3Q5JRS4 329 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8N976 141 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VN1R17PQ8TDU5 208 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAV3Q8IVL0 2385 aa19.25■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRS3P32247 399 aa19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL19P84098 196 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIEN1Q9BRT3 115 aa19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LY6LH3BQJ8 138 aa19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMY1AP04745 511 aa19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 REG1AP05451 166 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MGST1P10620 155 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFNA4P52798 201 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM183BQ1AE95 376 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEX45Q8NA69 505 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RCHY1Q96PM5 261 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAM16Q9Y3D7 125 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PPI3 338 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PRD5 423 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PRF3 423 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PRM7 423 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0R1W7 72 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BMPR1BO00238 502 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNXAQ16473 311 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00479Q96M42 142 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF2Q99496 336 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HILPDAQ9Y5L2 63 aa19.23■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HTR1DP28221 377 aa19.22■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF124Q15973 351 aa19.22■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGFBPL1Q8WX77 278 aa19.22■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM168AQ92567 244 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNS1Q96KK3 526 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VAMP8Q9BV40 100 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIGLEC9Q9Y336 463 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PS18 150 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM23O14925 209 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CA1P00915 261 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HLA-DQA1P01909 254 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NHLRC2Q8NBF2 726 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR11H6Q8NGC7 330 aa19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IZUMO1RA6ND01 250 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRYGBP07316 175 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APELAP0DMC3 54 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PATE2Q6UY27 113 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERTAD4Q9NUC0 356 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNA1BQ00975 2339 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PYYP10082 97 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRTN3P24158 256 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRIP30626 198 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASPHD1Q5U4P2 390 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXL15Q9H469 300 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRN1Q9NPD7 142 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPM3Q9P2X0 92 aa19.2■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QZK8 103 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HCP5Q6MZN7 132 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBD6Q96DN6 1003 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF586Q9NXT0 402 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL12A1Q99715 3063 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF329Q86UD4 541 aa19.19■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF253O75346 499 aa19.18■□□□□ 0.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV3-48P01763 117 aa19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms