RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 TMEM68Q96MH6 324 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 CLDN34H7C241 214 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 GNG7O60262 68 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 OR2J3O76001 311 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TOMM40O96008 361 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 LINC01551Q86U37 167 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 C21orf62Q9NYP8 219 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 S4R3C0 116 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 LRRK2Q5S007 2527 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 GGTLC3B5MD39 225 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 RAB5AP20339 215 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ECSCRQ19T08 205 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 F8W735 103 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ELOBQ15370 118 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 MLXQ9UH92 298 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 FBN2P35556 2912 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 LINC01548A6NM66 108 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 J3QLI3 93 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 AMY1AP04745 511 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 PLA2G2AP14555 144 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 Q56UQ5 140 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 RNF223E7ERA6 249 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 CRYBB3P26998 211 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 VN1R17PQ8TDU5 208 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 Q8WTZ3 238 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ANAPC16Q96DE5 110 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TXN2Q99757 166 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 A6NDX4 124 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 H3BUX3 64 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 C9JCJ5 164 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 G3V318 75 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 J3QKU1 62 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TGFAP01135 160 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 GP9P14770 177 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 Q5PR19 223 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 RNF125Q96EQ8 232 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 LEMD1Q68G75 181 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 LY96Q9Y6Y9 160 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-210ENST00000567949 HELTA6NFD8 242 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 H7BYZ3 331 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 SCGB2A1O75556 95 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 IGHV3-23P01764 117 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 IL4P05112 153 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 CXCL1P09341 107 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 LY6EQ16553 131 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 ZNF329Q86UD4 541 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 ABCA1O95477 2261 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 NBEAP1P0C6P0 100 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 CD99P14209 185 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 RHOGP84095 191 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 OCC1Q8TAD7 63 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 MBD6Q96DN6 1003 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 H3BRN7 92 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 IGHV4-31P0DP07 118 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 MYCNOSP40205 109 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 C15orf32Q32M92 178 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 PITPNC1Q9UKF7 332 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 OR2T8A6NH00 312 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 C1orf196B1AJZ1 125 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 M0QZK8 103 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 CTSGP08311 255 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 C19orf54Q5BKX5 351 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 NECAP1Q8NC96 275 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 ZNF502Q8TBZ5 544 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 BLNKQ8WV28 456 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 VPS13CQ709C8 3753 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTU2-210ENST00000567949 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms