RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 MORN5Q5VZ52 161 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 ACSM6Q6P461 480 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 COL7A1Q02388 2944 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 OR10J1P30954 320 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 RIPPLY3P57055 190 aa6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 MIC13Q5XKP0 118 aa6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 TMUB2Q71RG4 321 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 SSX7Q7RTT5 188 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 NOXA1Q86UR1 476 aa6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 OR11H1Q8NG94 326 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 C17orf77Q96MU5 243 aa6.31□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 RSG1Q9BU20 258 aa6.31□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GUS0 222 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 SMCO3A2RU48 225 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 AGPAT2O15120 278 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 PSG1P11464 419 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 ARL3P36405 182 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.43e-7■■■□□ 18.9
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TMOD3-211ENST00000561438 ZNF345Q14585 488 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 ZFP69Q49AA0 526 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 ST8SIA2Q92186 375 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 ATP5SQ99766 215 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 ARV1Q9H2C2 271 aa6.3□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 CORTO00230 105 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 RLN2P04090 185 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 FGF7P21781 194 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 SYNJ2BPP57105 145 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 BTNL8Q6UX41 500 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 STX12Q86Y82 276 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.29□□□□□ -1.4
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TMOD3-211ENST00000561438 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.29□□□□□ -1.4
TMOD3-211ENST00000561438 CXorf58Q96LI9 332 aa6.29□□□□□ -1.4
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