RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 APC2O95996 2303 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.19□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MGAMO43451 1857 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ODAMA1E959 279 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C7orf71A4D174 169 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf142B7Z368 130 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DHFRP00374 187 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 COX5BP10606 129 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IFITM1P13164 125 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RAB5BP61020 215 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PMAIP1Q13794 54 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ESRGQ1W209 222 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LPCAT3Q6P1A2 487 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LRRN1Q6UXK5 716 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 Q6ZQY7 126 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LYG2Q86SG7 212 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 Q86TA4 180 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GDPD1Q8N9F7 314 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR13D1Q8NGV5 346 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CANT1Q8WVQ1 401 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PLAC4Q8WY50 150 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00052Q96N35 136 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OSTCQ9NRP0 149 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.2□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TNS3Q68CZ2 1445 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP6Q13023 2319 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DPRXA6NFQ7 191 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GADD45GO95257 159 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PPYP01298 95 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CD2P06729 351 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR5G3P0C626 314 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR4E1P0C645 316 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 COX7CP15954 63 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MYL12AP19105 171 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CASP1P29466 404 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FXYD4P59646 89 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RHOBP62745 196 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SKP1P63208 163 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR52L1Q8NGH7 329 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PIGXQ8TBF5 258 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RAB8BQ92930 207 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TOMM6Q96B49 74 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LYSMD1Q96S90 227 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BCL2L10Q9HD36 194 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OPTCQ9UBM4 332 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HSPB8Q9UJY1 196 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.21□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRDP23468 1912 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087X0T9 212 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FAM25EA8MYX2 175 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FXYD1O00168 92 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 APOEP02649 317 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RPS12P25398 132 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK13Q1W4C9 94 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C4orf22Q6V702 233 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CASC2Q6XLA1 102 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ARL17AQ8IVW1 177 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR52R1Q8NGF1 315 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR5D14Q8NGL3 314 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BLQ99880 126 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR51I1Q9H343 314 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CMTM6Q9NX76 183 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FBXL12Q9NXK8 326 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR52A1Q9UKL2 312 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PCTPQ9UKL6 214 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LY96Q9Y6Y9 160 aa-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms