RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-215ENST00000557654 PSMF1Q92530 271 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 NAT6Q93015 286 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SPTSSAQ969W0 71 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TMEM186Q96B77 213 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 APH1AQ96BI3 265 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 STARD4Q96DR4 205 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SMIM12Q96EX1 92 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 KCNS1Q96KK3 526 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TXN2Q99757 166 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.06□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 A0A1W2PRS3 328 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 OR5B21A6NL26 309 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TMEM238C9JI98 176 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 F5H5K5 113 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 S1PR2O95136 353 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 VAMP5O95183 116 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IGKV1-39P01597 117 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IGKV1-5P01602 117 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IGKV1D-39P04432 117 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IGLL1P15814 213 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CAPZBP47756 277 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 REG1BP48304 166 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CLDN18P56856 261 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 FGF12P61328 243 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ZNF90Q03938 601 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 RASL11AQ6T310 242 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 LRP11Q86VZ4 500 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 NIT1Q86X76 327 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CST9LQ9H4G1 147 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SLC25A22Q9H936 323 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 HES4Q9HCC6 221 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CLN8Q9UBY8 286 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 FREM3P0C091 2139 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 MPDZO75970 2070 aa3.05□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 DPRXA6NFQ7 191 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 H0YJW9 148 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 H3BP45 60 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 K7ERU9 68 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CDIPTO14735 213 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TAX1BP3O14907 124 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 MPDU1O75352 247 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TRAPPC6AO75865 159 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TNFSF15O95150 251 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CA2P00918 260 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TGFAP01135 160 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 HLA-DQA1P01909 254 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 SCTP09683 121 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 LINC00869P0C866 280 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 C3orf79P0CE67 100 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 IAPPP10997 89 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CBLN1P23435 193 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CEACAM3P40198 252 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 PTGDSP41222 190 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 GABRA2P47869 451 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ATP5G3P48201 142 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 ZNF83P51522 516 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 KRTDAPP60985 99 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 PSG4Q00888 419 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TGFBR3Q03167 851 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 LCE1CQ5T751 118 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 CARD17Q5XLA6 110 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 STUMQ69YW2 141 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 PP632Q6XCG6 107 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 Q6ZSR6 202 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 TCF23Q7RTU1 214 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 DEFB125Q8N687 156 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 FADS6Q8N9I5 356 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 OR2M3Q8NG83 312 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.04□□□□□ -1.92
GPHN-215ENST00000557654 C7orf33Q8WU49 177 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms