RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGKV1-17P01599 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 AMY1AP04745 511 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C8orf88P0DMB2 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 HNF1AP20823 631 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TAS2R45P59539 299 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 BPIFB3P59826 476 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ADIRFQ15847 76 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 Q6ZS46 218 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 THAP8Q8NA92 274 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 BLNKQ8WV28 456 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ZNF503Q96F45 646 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 DUX5Q96PT3 197 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PARLQ9H300 379 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NF1P21359 2839 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 HYPMO75409 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CLN5O75503 358 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGHV4-59P01825 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NPPCP23582 126 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C15orf32Q32M92 178 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TRGV9Q99603 122 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 THYN1Q9P016 225 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IL4P05112 153 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GATA3P23771 443 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 RHOGP84095 191 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TVP23CQ96ET8 276 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PFDN5Q99471 154 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PSMB11A5LHX3 300 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 RANP62826 216 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GNB4Q9HAV0 340 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GPR183P32249 361 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 MFAP4P55083 255 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PAXXQ9BUH6 204 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CLEC3BP05452 202 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CRYBB3P26998 211 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 OR51M1Q9H341 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM250H0YL14 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ZNF329Q86UD4 541 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SGK494Q96LW2 274 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PDZD2O15018 2839 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CUBNO60494 3623 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 GGTLC3B5MD39 225 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PDE6DO43924 150 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PMS2P11Q13670 270 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 NECAP1Q8NC96 275 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-215ENST00000549143 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 F8W735 103 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OR2C1O95371 312 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RHEBQ15382 184 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RNF125Q96EQ8 232 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 LINC00479Q96M42 142 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGHV3-11P01762 117 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms