RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545331.5

TULP3-208, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 2

Gene TULP3, Length 1,373 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-208	ENST00000545331	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	DEDD	O75618	318 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	SIX6	O95475	246 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	BCAP31	P51572	246 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	CAV2	P51636	162 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	CD81	P60033	236 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	H2BFS	P57053	126 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF90	Q03938	601 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331		U3KQE9	123 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	CCNK	O75909	580 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	PET100	P0DJ07	73 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	STX12	Q86Y82	276 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TULP3-208	ENST00000545331		E5RGE8	158 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	CD7	P09564	240 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SULT1A1	P50225	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	S100A7	P31151	101 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	P2RY1	P47900	373 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SELENOT	P62341	195 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	HBG1	P69891	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	HBG2	P69892	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	OXA1L	Q15070	435 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	HELT	A6NFD8	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	S100A11	P31949	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	LYZ	P61626	148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	BUB3	O43684	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	DFFB	O76075	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	CST7	O76096	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	MED28	Q9H204	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	MPC2	O95563	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	BAX	Q07812	192 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	OR2F1	Q13607	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	PLP1	P60201	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	FBXL17	Q9UF56	701 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331		H0YIZ8	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	RAB31	Q13636	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TULP3-208	ENST00000545331	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TULP3-208	ENST00000545331	CXCL3	P19876	107 aa		13.71	□□□□□ -0.22

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