RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1B0GTI1	187 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	OR5H14	A6NHG9	310 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	METTL15	A6NJ78	407 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089		H0YJX3	145 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GNGT2	O14610	69 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SULT1B1	O43704	296 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ORC5	O43913	435 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SLC22A5	O76082	557 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	LY6G6C	O95867	125 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ISG15	P05161	165 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	STAG3L2	P0CL84	134 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ATF1	P18846	271 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	AZU1	P20160	251 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	PFN2	P35080	140 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GNG10	P50151	68 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TCTA	P57738	103 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CXCR4	P61073	352 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CACNG7	P62955	275 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CDK5	Q00535	292 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GPR176	Q14439	515 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	PLGLA	Q15195	96 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ACTBL2	Q562R1	376 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	DHFR2	Q86XF0	187 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	PXT1	Q8NFP0	134 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	S100A13	Q99584	98 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	RNF5	Q99942	180 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TMED9	Q9BVK6	235 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	PARP11	Q9NR21	331 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC42	Q9Y546	428 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		2.56	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0J9YXV3	536 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PPV4	95 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM223	A0PJW6	202 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM212	A6NML5	194 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SLC22A1	O15245	554 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	DCTN3	O75935	186 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFA3	O95167	84 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	BRI3	O95415	125 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CD2	P06729	351 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CGB3	P0DN86	165 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CGB7	P0DN87	165 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	BMI1	P35226	326 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	REG1B	P48304	166 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TPPP2	P59282	170 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SYCN	Q0VAF6	134 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	RSU1	Q15404	277 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	MPV17L2	Q567V2	206 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NEK7	Q8TDX7	302 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	GHSR	Q92847	366 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ARL11	Q969Q4	196 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SPACA5	Q96QH8	159 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	WFDC1	Q9HC57	220 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	JPT1	Q9UK76	154 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	AIP	O00170	330 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	APCS	P02743	223 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	TRGV3	P03979	118 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	HTR1A	P08908	422 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF688	P0C7X2	276 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	NPY1R	P25929	384 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-223	ENST00000536089	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2

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