RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529764.1

LTBP3-215, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, human

TSL 5

Gene LTBP3, Length 528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP3-215	ENST00000529764	RNF183	Q96D59	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	RARRES2	Q99969	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	RETN	Q9HD89	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTBP3-215	ENST00000529764	NDUFB6	O95139	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	ZNF79	Q15937	498 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MLANA	Q16655	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764		L7N2F9	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IAPP	P10997	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PSG1	P11464	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	GALR1	P47211	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MEOX2	P50222	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	RAP2B	P61225	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LYZ	P61626	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	VAMP2	P63027	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	GPR82	Q96P67	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	TRGV9	Q99603	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764		A0A0J9YWU9	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LCE6A	A0A183	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764		K7EQG2	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PITX3	O75364	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	OR4E1	P0C645	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IL7	P13232	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	GAMT	Q14353	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LYRM1	O43325	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	BUB3	O43684	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SSSCA1	O60232	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IL5	P05113	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MIF	P14174	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	PSMB3	P49720	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	SELENOT	P62341	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	RAB31	Q13636	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	BAK1	Q16611	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LTBP3-215	ENST00000529764	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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