RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	C3orf84	H3BNL1	204 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EQG2	157 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SSSCA1	O60232	199 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	MED6	O75586	246 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB131A	P59861	70 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	OR2F1	Q13607	317 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB135	Q30KP9	77 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	DCANP1	Q8TF63	244 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1W2PS18	150 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ZFP92	A6NM28	416 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	BUB3	O43684	328 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SCGB2A1	O75556	95 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SCGB1D2	O95969	90 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB11A	P62491	216 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	THAP8	Q8NA92	274 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	IFNA21	P01568	189 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	LYL1	P12980	280 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	BMI1	P35226	326 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	LYZ	P61626	148 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	PAFAH1B2	P68402	229 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ARL16	Q0P5N6	197 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	S100Z	Q8WXG8	99 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	TRGV9	Q99603	122 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	TENM2	Q9NT68	2774 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SPRY2	O43597	315 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	UPK1B	O75841	260 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	CD5	P06127	495 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	APOC4	P55056	127 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB1	P60022	68 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ASAH1	Q13510	395 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF183	Q96D59	192 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	SMIM8	Q96KF7	97 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A0J9YWU9	116 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	C7orf66	A4D0T2	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM25E	A8MYX2	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EPK0	472 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	C4BPB	P20851	252 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	AKR1C1	Q04828	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF846	Q147U1	533 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6ZWC4	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-222	ENST00000523555	KMT2A	Q03164	3969 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	SMCO3	A2RU48	225 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	HELT	A6NFD8	242 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	SOCS3	O14543	225 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-222	ENST00000523555	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3

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