RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ALDH3B2P48448 385 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 C12orf74Q32Q52 190 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 U3KQ87 197 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 CCR6P51684 374 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 LYZL2Q7Z4W2 148 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 LGI3Q8N145 548 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 DTD1Q8TEA8 209 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 RNF125Q96EQ8 232 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 RNF126Q9BV68 326 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 PBDC1Q9BVG4 233 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 RBKSQ9H477 322 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 HSPB7Q9UBY9 170 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 RABL2BQ9UNT1 228 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 A0A0B4J2A0 478 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 AKR1C4P17516 323 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SMCO1Q147U7 214 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SCGB3A2Q96PL1 93 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 MCUBQ9NWR8 336 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SHPKQ9UHJ6 478 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DRB4P13762 266 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 DEFB1P60022 68 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 ZNF90Q03938 601 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 ZFP92A6NM28 416 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 IGKV3-20P01619 116 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 FXYD7P58549 80 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 GAMTQ14353 236 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 LINC00052Q96N35 136 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 AMBPP02760 352 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 OR8G2PQ6IF36 304 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 GSG1LQ6UXU4 331 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 OR1S1Q8NH92 325 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SLC35E1Q96K37 410 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 HERC2O95714 4834 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ANXA3P12429 323 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ID1P41134 155 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 LYZP61626 148 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SRPXP78539 464 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SNRPGP15A8MWD9 76 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF8P32971 234 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 EMP1P54849 157 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 OR2F1Q13607 317 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 NEU1Q99519 415 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SOSTQ9BQB4 213 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 NDUFAF3Q9BU61 184 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 DNAH6Q9C0G6 4158 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 FABP12A6NFH5 140 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SOCS3O14543 225 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 FABP1P07148 127 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.11□□□□□ -0.47
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HERC3-211ENST00000513325 FAM231AP0DMU4 169 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 FAM231CP0DMU5 169 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PSMB3P49720 205 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 TMBIM6P55061 237 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 COQ8AQ8NI60 647 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R14BQ96C90 147 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PITX3O75364 302 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 IAPPP10997 89 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 TMED4Q7Z7H5 227 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF709Q8N972 641 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 TRGV9Q99603 122 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
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