RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1B0GXF2 115 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF785A8K8V0 405 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7EP13 123 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OVOL3O00110 214 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 COX7A2P2O60397 106 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2orf83Q53S99 150 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 GAFA1Q96PS6 74 aa5.5□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYCNOSP40205 109 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDKN1BP46527 198 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAS2R45P59539 299 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCL8P80075 99 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5B3Q8NH48 314 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 HARBI1Q96MB7 349 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRNDQ9UKY0 176 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PRD5 423 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PRF3 423 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PRM7 423 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SARAFQ96BY9 339 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 EPDR1Q9UM22 224 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM11P17152 192 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNTFRP26992 372 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIR2DS2P43631 304 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CORO2AQ92828 525 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C17orf77Q96MU5 243 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.49□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAP30O75446 220 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2J3O76001 311 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 LEPROTL1O95214 131 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZPBPQ9BS86 351 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 MLST8Q9BVC4 326 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CST9LQ9H4G1 147 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD59P13987 128 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSG9Q00887 426 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 POU2AF1Q16633 256 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM177Q53S58 311 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPTBN2O15020 2390 aa5.48□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 FNDC10F2Z333 226 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 UQCRFS1P47985 274 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 HBBP68871 147 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PPI3 338 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A17O43808 307 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV1-46P01743 117 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLL1O00548 723 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV2-23P01705 113 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM27E3Q08E93 113 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 RTL8BQ17RB0 113 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 hADV38S2A0JD32 116 aa5.46□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.46□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPIAL4DF5H284 164 aa5.46□□□□□ -1.53
RAPGEF6-211ENST00000512611 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms