RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H4G	Q99525	98 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NBR2	O15453	112 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	AREG	P15514	252 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN1A	P38936	164 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PLP1	P60201	277 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PET117	Q6UWS5	81 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		A1L4Q6	167 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		H7C2G1	150 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PCP4	P48539	62 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LYPD6	Q86Y78	171 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	OTOR	Q9NRC9	128 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TNC	P24821	2201 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		A6NNC1	897 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV3	P03979	118 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00614	P0C842	121 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PSG1	P11464	419 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	RAB9A	P51151	201 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5J2	P56134	94 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZR03	302 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PTPN13	Q12923	2485 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	COL4A3	Q01955	1670 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193		C9JCJ5	164 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	NIT1	Q86X76	327 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	ORMDL3	Q8N138	153 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS8	Q16651	343 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TNFSF13	O75888	250 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	IGHG3	P01860	377 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-11	P01762	117 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS2	P07478	247 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RPRML	Q8N4K4	120 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	GAFA1	Q96PS6	74 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM178B	H3BS89	294 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	WNT2	P09544	360 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LMO1	P25800	156 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DYSF	O75923	2080 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		H0YJW9	148 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	KLRB1	Q12918	225 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FOXC2	Q99958	501 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H12	B2RN74	326 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV2-5	P01817	119 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK11-1	P61568	191 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H1	Q8NG94	326 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H2	Q8NH07	326 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LY6H	O94772	140 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf79	P0CE67	100 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		Q6AWC8	147 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		6.57	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms