RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-218	ENST00000511185	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185		A0A1W2PS18	150 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	DEFB131A	P59861	70 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	RAB11A	P62491	216 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	ID3	Q02535	119 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	OR2F1	Q13607	317 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185		K7EQG2	157 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	APOC4	P55056	127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	STPG3	Q8N7X2	389 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-218	ENST00000511185	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	IFNA21	P01568	189 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	CD5	P06127	495 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	LYL1	P12980	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	PAX9	P55771	341 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	LYZ	P61626	148 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	IFITM3	Q01628	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	THAP8	Q8NA92	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	RYR2	Q92736	4967 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	BUB3	O43684	328 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ASAH1	Q13510	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	TRGV9	Q99603	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	UPK1B	O75841	260 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	HELT	A6NFD8	242 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	SPRY2	O43597	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185		Q6ZWC4	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185		A0A0J9YWU9	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	RNF183	Q96D59	192 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	C4BPB	P20851	252 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-218	ENST00000511185	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185		K7EPK0	472 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	UBE2C	O00762	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	DEFB1	P60022	68 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	TSC22D2	O75157	780 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	FABP1	P07148	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-218	ENST00000511185	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22

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