RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CORT	O00230	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FCN1	O00602	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR7C2	O60412	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MMP23A	O75900	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RBP4	P02753	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFB7	P17568	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	BMP5	P22003	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CRYBB3	P26998	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RNF5	Q99942	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DYSF	O75923	2080 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		M0QZK8	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ACTL6B	O94805	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	AMY1A	P04745	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CRYGC	P07315	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	BRS3	P32247	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DLX6	P56179	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PLP1	P60201	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	UTF1	Q5T230	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PERP	Q96FX8	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TRGV9	Q99603	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	LRBA	P50851	2863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC17A3	O00476	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RAB4A	P20338	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CBLN1	P23435	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CHRNB4	P30926	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MYCNOS	P40205	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CA7	P43166	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IER3	P46695	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PRRX1	P54821	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CCL8	P80075	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CT83	Q5H943	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms