RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf173Q96LM9 149 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 CLN5O75503 358 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFB8O95169 186 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 OR10J1P30954 320 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 S100A7P31151 101 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 GPR183P32249 361 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 SELENOTP62341 195 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 GAMTQ14353 236 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 S100A7AQ86SG5 101 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 STOML3Q8TAV4 291 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 GNB4Q9HAV0 340 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-211ENST00000497210 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 OR2T8A6NH00 312 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TGOLN2O43493 480 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CAMLGP49069 296 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ARL16Q0P5N6 197 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 OPCMLQ14982 345 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 AWAT1Q58HT5 328 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 BTNL8Q6UX41 500 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 THAP8Q8NA92 274 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 NPIPB3Q92617 1050 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TRGV9Q99603 122 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-11P01762 117 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 IGLC1P0CG04 106 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ARL3P36405 182 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 DEFA5Q01523 94 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 NEU1Q99519 415 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 KLK15Q9H2R5 256 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 NF1P21359 2839 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF785A8K8V0 405 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 AGPAT2O15120 278 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 TOMM40O96008 361 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-48P01763 117 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-23P01764 117 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZP3P21754 424 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 GCSHP23434 173 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 RUNX1Q01196 453 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF616Q08AN1 781 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 RPEL1Q2QD12 228 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZRG5 221 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 BAP18Q8IXM2 172 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 PFDN5Q99471 154 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 GINS3Q9BRX5 216 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 RNF24Q9Y225 148 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 S4R3C0 116 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 JMJD1CQ15652 2540 aa7.5□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 BMPR1BO00238 502 aa7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 MBP02144 154 aa7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC3BP05452 202 aa7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 CD28P10747 220 aa7.49□□□□□ -1.21
CTPS1-211ENST00000497210 BMI1P35226 326 aa7.49□□□□□ -1.21
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