RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 MED6O75586 246 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CCNKO75909 580 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SCGB1D2O95969 90 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IFNA10P01566 189 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CLEC3BP05452 202 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CXCL3P19876 107 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 NPY1RP25929 384 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GPR183P32249 361 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RAB32Q13637 225 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM8Q96KF7 97 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR2T8A6NH00 312 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 H0YIZ8 118 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CORTO00230 105 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TGOLN2O43493 480 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SSNA1O43805 119 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR2C1O95371 312 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CTSGP08311 255 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 EDN2P20800 178 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ARL3P36405 182 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OPRK1P41145 380 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SYNJ2BPP57105 145 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 FCN2Q15485 313 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RAB40CQ96S21 281 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 NMES1Q9C002 83 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PSENENQ9NZ42 101 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TSC22D2O75157 780 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CSN3P07498 182 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ZP3P21754 424 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RND2P52198 227 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MFAP4P55083 255 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TAS2R30P59541 319 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ARL16Q0P5N6 197 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RPEL1Q2QD12 228 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 Q56UQ5 140 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 FAM209BQ5JX69 171 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 DEFB125Q8N687 156 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR4X1Q8NH49 305 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ATP6V0BQ99437 205 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TXN2Q99757 166 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CLN5O75503 358 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV1-17P01599 117 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 IFNA4P05014 189 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CD81P60033 236 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP10-2P60368 255 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 S100A10P60903 97 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GAMTQ14353 236 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 LCN12Q6JVE5 192 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 NOXA1Q86UR1 476 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 GPHB5Q86YW7 130 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 RNF126Q9BV68 326 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 MED28Q9H204 178 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C9orf135-204ENST00000495399 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 IGSF23A1L1A6 192 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM213A2RRL7 107 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 A8MWP6 167 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-204ENST00000495399 G3V3Q6 166 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms