RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	CNIH1	O95406	144 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	CRYGC	P07315	174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	CCL3L1	P16619	93 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	HTR1D	P28221	377 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MFAP2	P55001	183 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PSG9	Q00887	426 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PDE6H	Q13956	83 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FAM201A	Q5SY85	155 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TXN2	Q99757	166 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NRN1	Q9NPD7	142 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TECTA	O75443	2155 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	DOCK7	Q96N67	2140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PSMB11	A5LHX3	300 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		M0R1W7	72 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		M0R2Z0	102 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NBL1	P41271	181 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	REG1B	P48304	166 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TDGF1P3	P51864	188 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SLURP1	P55000	103 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00310	P59036	64 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	WT1-AS	Q06250	92 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	OR5I1	Q13606	314 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MMD	Q15546	238 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PRR27	Q6MZM9	219 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	ARID1A	O14497	2285 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1B0GV90	55 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1W2PPI3	338 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1W2PS18	150 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	HIGD1C	A8MV81	97 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	BMPR1B	O00238	502 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MOS	P00540	346 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	LTA	P01374	205 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	IGLV2-23	P01705	113 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TCRA	P04437	139 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SFTPC	P11686	197 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NTF3	P20783	257 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	BMI1	P35226	326 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MFAP4	P55083	255 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TCL1A	P56279	114 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	LYZ	P61626	148 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	GAGE1	Q13065	139 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FXYD3	Q14802	87 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MUC15	Q8N387	334 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228		Q9H3A6	140 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	DNAJC13	O75165	2243 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LRP2-204	ENST00000491228	REV3L	O60673	3130 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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