RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN5P62079 268 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 NEDD8Q15843 81 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 BSXQ3C1V8 233 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 AARDQ4LEZ3 155 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 LEMD1Q68G75 181 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4X1Q8NH49 305 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 DCANP1Q8TF63 244 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 GINS3Q9BRX5 216 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXL17Q9UF56 701 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.58□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.57□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 CLN5O75503 358 aa4.57□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 S100GP29377 79 aa4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TP53RKQ96S44 253 aa4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PKD1P98161 4303 aa4.57□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0G2JRQ6 117 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GVY2 172 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PS18 150 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLL5B9A064 214 aa4.56□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 ELK1P19419 428 aa4.56□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 HLA-DMBP28068 263 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 RCVRNP35243 200 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SNCAP37840 140 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 ETV6P41212 452 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 P2RY1P47900 373 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP5CP53041 499 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SPINK9Q5DT21 86 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB40CQ96S21 281 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF126Q9BV68 326 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.56□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK11Q9UBX7 282 aa4.56□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 KNCNA6PVL3 124 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 CDS2O95674 445 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 IFNA17P01571 189 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 CD3DP04234 171 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLC1P0CG04 106 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 UCP1P25874 307 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PIGPP57054 158 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 ERVFC1-1P60608 527 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 C12orf74Q32Q52 190 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 OR52E5Q8NH55 327 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TERB2Q8NHR7 220 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 METTL26Q96S19 204 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.55□□□□□ -1.68
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PRPF40A-210ENST00000489741 RABAC1Q9UI14 185 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 AGRNO00468 2067 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A087WXM4 84 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 H3BMM0 161 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 HPGDSO60760 199 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GALNT1O75752 331 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG12O94817 140 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF688P0C7X2 276 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 PGAM2P15259 253 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TBPP20226 339 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 HTR2BP41595 481 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SPCS3P61009 180 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 VBP1P61758 197 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 NCS1P62166 190 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 SP6Q3SY56 376 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 TIGITQ495A1 244 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf83Q53S99 150 aa4.54□□□□□ -1.68
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