RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, human

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNKSR1-208	ENST00000484874	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	S100A10	P60903	97 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZNF90	Q03938	601 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IL4	P05112	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	BCAP31	P51572	246 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CAV2	P51636	162 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	OXA1L	Q15070	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874		E5RGE8	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CD7	P09564	240 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	S100A11	P31949	105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SULT1A1	P50225	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SELENOT	P62341	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874		H0YIZ8	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	BUB3	O43684	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	DFFB	O76075	338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	P2RY1	P47900	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CD81	P60033	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	MED28	Q9H204	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CST7	O76096	145 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	MPC2	O95563	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	HBG1	P69891	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	HBG2	P69892	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	STX12	Q86Y82	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	PET100	P0DJ07	73 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	CXCL3	P19876	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	PLP1	P60201	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR2F1	Q13607	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	HELT	A6NFD8	242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	S100A7	P31151	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	LYZ	P61626	148 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	TG	P01266	2768 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	BAX	Q07812	192 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	FCN2	Q15485	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CNKSR1-208	ENST00000484874	LYL1	P12980	280 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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