RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DEFA5Q01523 94 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 AANATQ16613 207 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ECSCRQ19T08 205 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ARPC1AQ92747 370 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PRNDQ9UKY0 176 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 S4R3C0 116 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NF1P21359 2839 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 K7EPK0 472 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FGF16O43320 207 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SYNGR2O43760 224 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MPC2O95563 127 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM50AO95807 157 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-48P01763 117 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DRB1P01911 266 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBA1P05813 215 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR13C7P0DN81 318 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PAX9P55771 341 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SPCS3P61009 180 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PRCDQ00LT1 54 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 WT1-ASQ06250 92 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF9Q07011 255 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IL15RAQ13261 267 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB2A2Q13296 93 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM86BQ8N661 226 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR4A5Q8NH83 315 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SPIN2AQ99865 258 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RNF126Q9BV68 326 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NMES1Q9C002 83 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF702PQ9H963 129 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PN81 502 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 G3V3Q6 166 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CLDN34H7C241 214 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 L7N2F9 121 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 M0QZK8 103 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SOX15O60248 233 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PFDN1O60925 122 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA10P01566 189 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHG2P01859 326 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A6P12236 298 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DEFA4P12838 97 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PSMB6P28072 239 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MAS1LP35410 378 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNA7P36544 502 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SNCAP37840 140 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MFAP2P55001 183 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP14Q86UN6 197 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF429Q86V71 674 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR5B3Q8NH48 314 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DTD1Q8TEA8 209 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DCUN1D4Q92564 292 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR4C12Q96R67 309 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ENY2Q9NPA8 101 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 COA4Q9NYJ1 87 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PSENENQ9NZ42 101 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MBD2Q9UBB5 411 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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