RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
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SHQ1-208ENST00000482785 MAS1P04201 325 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 BPGMP07738 259 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 MYL12AP19105 171 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 RPL12P30050 165 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 OMPP47874 163 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 DSCR10P59022 87 aa2.36□□□□□ -2.03
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SHQ1-208ENST00000482785 ZNF79Q15937 498 aa2.36□□□□□ -2.03
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SHQ1-208ENST00000482785 TSPAN31Q12999 210 aa2.34□□□□□ -2.03
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SHQ1-208ENST00000482785 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.34□□□□□ -2.03
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SHQ1-208ENST00000482785 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 OR5K1Q8NHB7 308 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 FXYD5Q96DB9 178 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC115Q96NT0 180 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 DPY30Q9C005 99 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 ACER3Q9NUN7 267 aa2.34□□□□□ -2.03
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