RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 EGR1P18146 543 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 TEX38Q6PEX7 206 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 ADCYAP1P18509 176 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 PAX8Q06710 450 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZS49 121 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 USMG5Q96IX5 58 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 TNFSF13O75888 250 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 CD33P20138 364 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 CRYBB3P26998 211 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 PRCDQ00LT1 54 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 EREGO14944 169 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 MLNRO43193 412 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 CD177Q8N6Q3 437 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 OR52E5Q8NH55 327 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 RNF138Q8WVD3 245 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 WFDC1Q9HC57 220 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-207ENST00000479054 RNF223E7ERA6 249 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SELLP14151 372 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 DTX2Q86UW9 622 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGFBP2P18065 325 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 PRTN3P24158 256 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IL36BQ9NZH7 164 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 A6NJY4 79 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SAP30O75446 220 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TDGF1P3P51864 188 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 NMSQ5H8A3 153 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 NRN1Q9NPD7 142 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CD55P08174 381 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 C2orf83Q53S99 150 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 RNF125Q96EQ8 232 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 Q96MF0 132 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 COL4A3Q01955 1670 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TMEM262E9PQX1 116 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 DKK1O94907 266 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 FMC1Q96HJ9 113 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 M0R3E3 92 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 EFNB3Q15768 340 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 GAFA1Q96PS6 74 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ADMP35318 185 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 Q6AWC8 147 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 JKAMPQ9P055 326 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 OVOL1O14753 267 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TDGF1P13385 188 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 HIST1H4GQ99525 98 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 S4R3C0 116 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 OTORQ9NRC9 128 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 PRSS8Q16651 343 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ASCL2Q99929 193 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CADP27708 2225 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SLC17A3O00476 420 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 PLA2G5P39877 138 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CCL20P78556 96 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 COQ2Q96H96 371 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GW15 77 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SGK494Q96LW2 274 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SIGMAR1Q99720 223 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TECTAO75443 2155 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 FAM223BA6NKX1 122 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 C9JCJ5 164 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 COL8A2P25067 703 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 TCF23Q7RTU1 214 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 SNAI2O43623 268 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 H3BUT2 72 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 IGKV1-5P01602 117 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-207ENST00000479054 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms