RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 AARDQ4LEZ3 155 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 C2orf83Q53S99 150 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 ZNF709Q8N972 641 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 NAA60Q9H7X0 242 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 NACAE9PAV3 2078 aa7.97□□□□□ -1.13
ACTB-209ENST00000473257 SCGB2A1O75556 95 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TOMM40O96008 361 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 CD74P04233 296 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A4P12235 298 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RORCP51449 518 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 OR2F1Q13607 317 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZR54 194 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C20orf173Q96LM9 149 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 DKK2Q9UBU2 259 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TNFAIP8O95379 198 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 IFNA21P01568 189 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 NMSQ5H8A3 153 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 OR52E5Q8NH55 327 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RNF125Q96EQ8 232 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RBKSQ9H477 322 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.95□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SOCS3O14543 225 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TBPP20226 339 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R19P59542 299 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 LYZP61626 148 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 CTF1Q16619 201 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 FAM78BQ5VT40 261 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 MZT2AQ6P582 158 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 FAM219AQ8IW50 185 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 NEU1Q99519 415 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RFNGQ9Y644 331 aa7.94□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ZFP92A6NM28 416 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 CTDSP2O14595 271 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GAMTQ14353 236 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GPR107Q5VW38 600 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 COQ8AQ8NI60 647 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C17orf77Q96MU5 243 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 HERC1Q15751 4861 aa7.93□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GABARAPH6UMI1 98 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GABARAPO95166 117 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SMIM18P0DKX4 95 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 IAPPP10997 89 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 PSG9Q00887 426 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TNP2Q05952 138 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 FCN2Q15485 313 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ZNF79Q15937 498 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 LGI3Q8N145 548 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 DTD1Q8TEA8 209 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 GPR132Q9UNW8 380 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.92□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 A0A0J9YX75 114 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 TMEM189A5PLL7 270 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 DISC1C4P0D8 188 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 M0R2Z0 102 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 RGS5O15539 181 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 HBE1P02100 147 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 AKR1C4P17516 323 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 PSMB3P49720 205 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 DAD1P61803 113 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 SPCS2Q15005 226 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-209ENST00000473257 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms