RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TAX1BP3O14907 124 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 IGHV1-46P01743 117 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CT83Q5H943 113 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ERASQ7Z444 233 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C22orf46C9J442 243 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LEPROTL1O95214 131 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LTAP01374 205 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 hADV38S2A0JD32 116 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 A8MWL6 223 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RHOGP84095 191 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 NKX2-8O15522 239 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 IGLV2-23P01705 113 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ORM2P19652 201 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 VAMP3Q15836 100 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PERPQ96FX8 193 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF492Q9P255 531 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 NUDT3O95989 172 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 P01737 135 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR4A5Q8NH83 315 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FMC1Q96HJ9 113 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CCL3L1P16619 93 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF137PP52743 207 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PPI3 338 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FCN3O75636 299 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 GP9P14770 177 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 DEFB125Q8N687 156 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MUC21Q5SSG8 566 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR2T8A6NH00 312 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 H3BTX0 84 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OVOL3O00110 214 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TCRAP04437 139 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 CRYGCP07315 174 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF138P52744 262 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.29□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LIPFP07098 398 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 Q9H3A6 140 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 OR5AL1P0C617 328 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FAM87AP0C7U9 286 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 RITA1Q96K30 269 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 LAMA5O15230 3695 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 FAM231BA6NCW3 169 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 HLA-DRB1P01911 266 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 PET117Q6UWS5 81 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 TRGV9Q99603 122 aa8.28□□□□□ -1.08
LINC00886-201ENST00000472943 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms