RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	DFFB	O76075	338 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R30	P59541	319 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR2F1	Q13607	317 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SSNA1	O43805	119 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	CCNK	O75909	580 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SIX6	O95475	246 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	CRYBB3	P26998	211 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902		A8MZ25	164 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CD5	P06127	495 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	P2RY1	P47900	373 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CAV2	P51636	162 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	LYZ	P61626	148 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	TRGV9	Q99603	122 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.27	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RAB32	Q13637	225 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	THAP8	Q8NA92	274 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	PTTG1	O95997	202 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	DLK1	P80370	383 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902		U3KQK5	164 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	HELT	A6NFD8	242 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CST7	O76096	145 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RLN2	P04090	185 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	IL15RA	Q13261	267 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	HAGH	Q16775	308 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902		U3KQE9	123 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	NMES1	Q9C002	83 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	BUB3	O43684	328 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	ORM2	P19652	201 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	ALG5	Q9Y673	324 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP19-210	ENST00000465902	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	DEDD	O75618	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	STX12	Q86Y82	276 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP19-210	ENST00000465902	SULT1A1	P50225	295 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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