RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.67□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 NUDT11Q96G61 164 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 KCNS1Q96KK3 526 aa14.67□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 SPTBN2O15020 2390 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 PGPA6NDG6 321 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.67□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.66□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 MUC15Q8N387 334 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 MBD6Q96DN6 1003 aa14.65□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SYNE4-204ENST00000465425 LINC01560Q8TB33 94 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 SGK494Q96LW2 274 aa14.65□□□□□ -0.06
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PS18 150 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 M0R143 59 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SLAQ13239 276 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM12Q96EX1 92 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 TDRG1Q3Y452 100 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 ATG101Q9BSB4 218 aa14.64□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL15Q9H469 300 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TEX22C9J3V5 150 aa14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 GP9P14770 177 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.63□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 CA7P43166 264 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 LYZP61626 148 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 FMC1Q96HJ9 113 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.62□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 DIRC3C9JPN6 131 aa14.61□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 Q9H3A6 140 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.61□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 OR8B2Q96RD0 313 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.61□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 PSG1P11464 419 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CAMPP49913 170 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RNF114Q9Y508 228 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TOMM40O96008 361 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TCRAP04437 139 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGLC1P0CG04 106 aa14.59□□□□□ -0.07
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