RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2CO00762 179 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN9O75954 239 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ACTL6BO94805 426 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TOX4O94842 621 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-48P01763 117 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OR10J4P0C629 311 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CD24P25063 80 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 SAA4P35542 130 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CEBPGP53567 150 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R45P59539 299 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2G2P60604 165 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IMMP2LQ96T52 175 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MLXQ9UH92 298 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 PRELID1Q9Y255 219 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CR1P17927 2039 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ITPR3Q14573 2671 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRF3 423 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRM7 423 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 A6NJY4 79 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 NPFFO15130 113 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 AMY1AP04745 511 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 PYYP10082 97 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 RAB5BP61020 215 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 FXYD3Q14802 87 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ADIRFQ15847 76 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CST9LP1Q5W188 147 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TEX38Q6PEX7 206 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF329Q86UD4 541 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OCC1Q8TAD7 63 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ARPC1AQ92747 370 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MISP3Q96FF7 219 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 UHRF2Q96PU4 802 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IFITM10A6NMD0 228 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 H3BRN7 92 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 H7BYZ3 331 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TGOLN2O43493 480 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 COX7A2P2O60397 106 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 OR7C2O60412 319 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BKO60814 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HYPMO75409 117 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 BRI3O95415 125 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TOMM40O96008 361 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 FSHBP01225 129 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 GCGP01275 180 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-69P01742 117 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BJP06899 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 APELAP0DMC3 54 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IGLC2P0DOY2 106 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 PSG1P11464 419 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BOP23527 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BBP33778 126 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BDP58876 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 BPIFB3P59826 476 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2BCP62807 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 FOXL1Q12952 345 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 TIGITQ495A1 244 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP82Q8N141 532 aa4.42□□□□□ -1.7
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