RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 BSXQ3C1V8 233 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 DTD1Q8TEA8 209 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GLMPQ8WWB7 406 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC35E1Q96K37 410 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NRN1Q9NPD7 142 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 APLNQ9ULZ1 77 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FABP12A6NFH5 140 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TOMM40O96008 361 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CCR6P51684 374 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB1P60022 68 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 LYZP61626 148 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SMCO1Q147U7 214 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 COQ8AQ8NI60 647 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF125Q96EQ8 232 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HRH4Q9H3N8 390 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 U3KQ87 197 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 U3KQE9 123 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 X6R8D5 127 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R2N4 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 BUB3O43684 328 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FABP1P07148 127 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 IAPPP10997 89 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB11AP62491 216 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF90Q03938 601 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PYDC2Q56P42 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 IL22RA2Q969J5 263 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CELA1Q9UNI1 258 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0B4J2A0 478 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BMM0 161 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CTDSPLO15194 276 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HTN3P15516 51 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 VAMP1P23763 118 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFSF8P32971 234 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SRPXP78539 464 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GAMTQ14353 236 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 C12orf74Q32Q52 190 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 AARDQ4LEZ3 155 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NMSQ5H8A3 153 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 MCFD2Q8NI22 146 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A22Q9H936 323 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 KMT2AQ03164 3969 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC160A6NGH7 325 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 WRBO00258 174 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 IFNA21P01568 189 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DRB4P13762 266 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ALDH3B2P48448 385 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FGL1Q08830 312 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 C16orf92Q96LL3 132 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF126Q9BV68 326 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SMCO3A2RU48 225 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 F6UB75 175 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 MED6O75586 246 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXB5P09067 269 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 P0DMU3 169 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM231AP0DMU4 169 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM231CP0DMU5 169 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ORM2P19652 201 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms