RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CBY3	A6NI87	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FGF2	P09038	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	UCHL1	P09936	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		P0C879	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PTHLH	P12272	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	DTYMK	P23919	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FCGR2C	P31995	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	G6PC	P35575	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LPAR6	P43657	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FXYD4	P59646	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PSG9	Q00887	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	STX12	Q86Y82	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	UFD1	Q92890	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		F6UB75	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TSC22D2	O75157	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HTR2B	P41595	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	RORC	P51449	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	IFITM3	Q01628	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		V9GY05	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CTDSP2	O14595	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SIVA1	O15304	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PPY	P01298	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	C1QB	P02746	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FCER2	P06734	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	AZU1	P20160	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CTF1	Q16619	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MLANA	Q16655	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		U3KQE9	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CLN5	O75503	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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